Kuvantamisinnovaatiot syntyvät poikkitieteellisellä ja monialaisella yhteistyöllä

Alt=""

Turussa on maailmanluokan osaamista ja tutkimusinfraa biokuvantamisessa. Turku BioImagingin Pasi Kankaanpää toivoo alalle entistä pitkäjänteisempää korkeakoulujen ja yritysten välistä yhteistyötä.

Biokuvantaminen, eli biologinen ja biolääketieteellinen kuvantaminen, on yksi tärkeimmistä tutkimusmenetelmäkokonaisuuksista taistelussa esimerkiksi syöpää, diabetesta ja tarttuvia tauteja vastaan.

– Yksinkertaistettuna biokuvantaminen on menetelmä, joka tuottaa kuvaa tai videota biologisesta näytteestä. Menetelmiä on molekyylitason kuvantamisesta kokonaisen ihmisen kuvantamiseen. Tälle välille mahtuu satoja teknologioita, Turku BioImagingin biologisen kuvantamisen johtaja Pasi Kankaanpää summaa.

Turussa on hänen mukaansa edustettuna pitkälti koko tämä skaala sekä osaamisessa että teknologioissa. Lisäksi Turku on ainoa paikka Suomessa, josta löytyy kuvantamisdatan analysointiin ja hallintaan erikoistunut palveluyksikkö.

Alt=""
Turku BioImagingin Pasi Kankaanpää kuulee usein väitteen akateemisen maailman hitaudesta ja kankeudesta yritysyhteistyössä. Hänen kokemuksensa on päinvastainen.

Kuvantaminen vaatii monenlaista osaamista. Turussa sen parissa työskentelee esimerkiksi lääketieteen, solu- ja molekyylibiologian, genetiikan, tietotekniikan, ohjelmoinnin, matematiikan, tilastotieteen, fysiikan ja kemian asiantuntijoita.

– Kuvantamisessa voi menestyä monella taustalla. Olennaista on tehdä työ yhdessä eri alojen osaajien kanssa ja hyödyntää myös muita teknologioita ja tutkimusinfroja, Kankaanpää sanoo.

Innovaatiokumppaneita etsimässä

Kuvantamisinnovaatiot vaativat laajaa poikkitieteellisyyttä, johon yksittäisillä tutkijoilla tai yrityksillä ei välttämättä ole aikaa tai resursseja. Turku BioImaging auttaa eri tahoja tekemään yhteistyötä ja löytämään ratkaisuja yli perinteisten raja-aitojen.

– Meillä on työntekijöitä, jotka keskittyvät poikkitieteellisten projektien löytämiseen ja eteenpäin viemiseen. Siinä tutkimuslaitosten ja yritysten välinen yhteistyö on hyvin olennaista, Kankaanpää sanoo.

Kuvantamislaitteet maksavat maltaita, ja niiden elinkaari on usein lyhyt. Siksi on tärkeää, että tutkimusinfraa jaetaan. 110 kuvantamisteknologiaa ympäri Eurooppaa on tutkijoiden ja yritysten käytettävissä Euro-BioImagingin kautta.

Suomesta mukana ovat parhaat kuvantamisyksiköt seitsemästä yliopistosta ja kolmesta yliopistosairaalasta Kankaanpään luotsaaman Euro-BioImaging Finlandin kautta.

– Näitä infroja johdetaan ja kehitetään ja kansainvälistä yhteistyötä koordinoidaan Turusta käsin, Kankaanpää sanoo.

Alt=""
Turun Biotiedekeskuksessa tehdään solutason kuvantamistutkimusta.


Yritysten kiinnostus kuvantamiseen kasvaa

Yritykset pienistä startupeista isoihin lääkejätteihin ovat Kankaanpään mukaan entistä innokkaampia kuvantamisteknologioiden käyttäjiä. Yritysten ja tutkimuslaitosten yhteistyössä on hänestä silti edelleen roimasti kasvunvaraa.

– Yritysten ja korkeakoulujen välinen yhteistyö on myös tutkitusti avain Suomen talouskasvuun ja pidemmän aikavälin menestykseen.

Kankaanpäästä yhteistyön suurin haaste on tiedonkulku akatemian ja yritysmaailman välillä. Biokuvantaminen kehittyy vauhdilla, ja kuvien analysointi on viimeisten 15 vuoden aikana kehittynyt kokonaan omaksi tieteenalakseen. Kuvantamisteknologioita on paljon, ja kuvantamisen nykymahdollisuuksia ei tunneta yrityksissä.

– Sama haaste on olemassa yhtä lailla akateemisessa maailmassa.

Kankaanpää muistuttaa, että kaikki innovaatiot perustuvat viimekädessä perustutkimukseen, joka täytyy turvata. Yritysyhteistyöhön halutaan Turku BioImagingissa silti satsata merkittävästi. Kankaanpään mukaan Business Turku on siinä arvokkaana apuna.

– Sieltä tulee ideoita, aloitteita, tapahtumia ja uusia yhteyksiä.

Alt=""
Turun Biotiedekeskuksen uusilla mikroskoopeilla saadaan eri väristen lasereiden avulla ennennäkemättömän tarkkoja kolmiulotteisia kuvia elävistä soluista.


Lukemattomia mahdollisuuksia

Biokuvantamisen avulla on saavutettu jo paljon. Kankaanpään mukaan moni reseptilääke olisi jäänyt kehittämättä ja Käypä hoito -suosituksia kirjaamatta ilman turkulaisten tutkimuslaitosten ja yritysten yhteisponnistuksia.

Paljon on myös kehitteillä. Turku BioImaging hakee rahoitusta hankkeelle, jossa selvitettäisiin yhdessä yritysten ja Turun yliopistollisen keskussairaalan kanssa, miten eri organisaatioiden kuvantamisdataa saataisiin jaettua ja analysoitua yhdessä.

– Jos haluamme opettaa tekoälyn tunnistamaan esimerkiksi syöpäsoluja luotettavasti, tarvitaan koulutusmateriaali, jota ei vielä ole koottuna yhteen paikkaan, Kankaanpää selittää.

Biokuvantamisen metodeista on hyötyä muillakin aloilla. Kankaanpään mukaan tällä hetkellä merkittävimmät sovellukset liittyvät meribiologiaan ja maatalouteen.

Turku BioImagingin kuva-analyysien avulla pystytään seuraamaan esimerkiksi metsän kasvua, vieraslajien määrää tai meriveden lämpötiloja laajalla alueella ja pitkällä aikavälillä.

– Jos kysyt soveltamisaloja uudelleen viiden vuoden päästä, vastaukset ovat varmasti taas ihan uudenlaisia, Kankaanpää sanoo.

Alt=""
Turku BioImaging tarjoaa kuvantamisdatan analyysipalveluita eri aloille. Tässä hankkeessa pyritään luomaan koko Saaristomeren kattavaa tietoa muun muassa meriveden lämpötilan muutoksista.

Teksti ja kuvat: Heidi Pelander